La tumorothèque virtuelle nationale (TVN)

Date de dernière mise à jour : 20/07/2010

L'Institut National du Cancer a développé une base de données permettant de centraliser et d'afficher sur le site Internet de l'INCa des données standardisées relatives aux prélèvements tumoraux collectés dans les tumorothèques à des fins scientifiques.

Cet outil national, intitulé Tumorothèque Virtuelle Nationale (TVN), a pour objectif de donner une visibilité et une accessibilité aux principales collections nationales d'échantillons constituées dans le cadre de réseaux et consortiums thématiques et de programmes de recherche nationaux ou internationaux.

Les annotations minimales recensées pour chacune des collections correspondent au référentiel national de l'INCa et sont complétées par des annotations spécifiques de chacune des pathologies concernées.

En juillet 2010, l'INCa inaugure l'accès à la TVN avec les données du programme PNES cancers du poumon.

Le programme PNES cancers du poumon, dont l'un des enjeux était d'analyser des biomarqueurs sur de grandes séries d'échantillons biologiques, a été le projet pilote du développement de la TVN. Un réseau de six tumorothèques a été constitué en vue de recenser et mettre en commun tous les échantillons biologiques de taille et de qualité suffisantes, selon les critères définis par les projets scientifiques. Dans le cadre d'accord partenariaux, plus de 1 600 échantillons biologiques ont été mis à la disposition des chercheurs et plus de 4 000 échantillons sont actuellement recensés dans la TVN. Le réseau est maintenant en mesure de maintenir une collecte d'échantillons biologiques d'environ 2 000 nouveaux prélèvements par an. Ce réseau offre aujourd'hui un fort potentiel pour les collaborations internationales et pour des études à grande échelle sur la génomique du cancer du poumon.

L'implémentation de la TVN est ouverte à l'ensemble des réseaux et consortiums thématiques nationaux et s'effectuera en collaboration avec leurs responsables scientifiques et institutionnels.

Contact : Angélique Michaut – Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir.