Le déroulement de la chimiothérapie est soigneusement planifié par l’équipe médicale en fonction de la situation du patient.

Le médecin qui le prend en charge lui remet un calendrier qui détermine le lieu et les jours de traitement, ainsi que les noms des médicaments utilisés.

La durée totale du traitement est variable en fonction des médicaments utilisés et de l’objectif de la chimiothérapie. Il se déroule soit de façon continue, tous les jours pendant une période donnée, soit par cycles (2 jours tous les 15 jours par exemple).

Chaque période de traitement, appelée cure, est suivie d’une période de repos.

Avant chaque cure, un examen clinique et des examens de sang sont réalisés pour s’assurer que l’état de santé général permet de poursuivre le traitement. En cas d’anomalies (baisse importante du taux de globules blancs par exemple), le traitement peut être remis à plus tard ou modifié.

Les médicaments sont généralement injectés dans une veine, par perfusion. Certains peuvent être donnés sous forme de comprimés : c’est ce qu’on appelle la chimiothérapie orale (la capécitabine et le tégafur uracile sont des chimiothérapies orales).

La chimiothérapie se déroule généralement à l’hôpital, en ambulatoire, c'est-à-dire que le patient ne reste que le temps de la perfusion et rentre chez lui le jour même. On parle aussi d’hospitalisation de jour.

Parfois, elle peut être réalisée à domicile. Un soignant vient alors chez le patient pour poser la perfusion et administrer les médicaments.

La chimiothérapie peut aussi être administrée grâce à une pompe ou un diffuseur, sorte de réservoir qui contient les médicaments. Reliés au cathéter et préprogrammés par l'équipe médicale, ces dispositifs diffusent automatiquement les médicaments selon le protocole prévu. Ils permettent de se déplacer et de poursuivre le traitement à domicile.